Natriumcitratbuffer brukes til RNA-isolasjon fordi den minimerer baselydrolysen av RNA-strengene. Dette gjør det til et viktig skritt i mRNA-rensingen under genomforskning eller for å studere transkripsjon.
Citratbaserte buffere kan også hjelpe deteksjon av antigener i fikserte vevspreparater fordi de bryter kryssbindingene dannet mellom antigenene og fikseringsmediene.
Med veiledningen nedenfor skal du lage en natriumcitratbuffer med pH 6. Instruksjonene er ikke bare enkle, men også raskere å utføre. Det bør bare ta deg ca. 10 minutter å fullføre disse trinnene.
To alternativer for å lage bufferen
Det er to måter å gå om å lage en natriumcitratbuffer. Først avgjøre om du har både sitronsyre og konjugatbasen, natriumcitrat, til å jobbe med. Hvis du bare har sitronsyre, er det ikke et problem. Du kan fortsatt lage bufferen.
På den annen side, hvis du har både syre og base, lager du en lagerløsning av hver. Bland 21 gram sitronsyre i 1 liter destillert vann og 29,4 gram natriumcitrat i 1 liter destillert vann.
Hvis du bare har sitronsyre, bland 2,1 gram i litt under 1 liter destillert vann og fortsett til neste trinn.
Blanding av sitronsyre og natriumkitratløsninger
Nå som du har opprettet lagerløsningen din (hvis du hadde både en syre og en base) eller blandet syre i destillert vann (hvis du ikke gjorde det), kan du fokusere på løsningene dine.
Bland 82 ml av sitronsyreoppløsningen med 18 ml natriumcitratoppløsning.
Deretter gjør det totale volumet av blandingen opp til like under 1 liter med destillert vann. Gi nok volum for å tillate tilsetning av natriumhydroksyd (NaOH) i neste trinn.
Justere pH
Ved forsiktig omrøring av oppløsningen ved hjelp av en magnetomrører, bruk 1M natriumhydroksyd for å justere pH i blandingen til 6,0. Deretter gjør det endelige volumet av oppløsningen opp til 1 liter med destillert vann ved å bruke en volumetrisk kolbe.
Hva du trenger for å lage bufferen
Ikke bare vil det ikke ta deg lang tid å lage natriumcitratbufferen, du vil heller ikke trenge mange materialer for det heller. Med sitronsyre, 1M natriumhydroksyd, destillert vann og en kalibrert pH-sonde, vil du være halvveis der. Bruk av natriumcitrat er valgfritt.
Å lage buffer vil også kreve en 1 liters graduert sylinder, en 1 liters volumetrisk kolbe og tre 1 liters medieflasker. Til slutt trenger du en magnetisk omrøringsbjelke og en magnetomrører.
Hvis du ikke har alle disse materialene, bør du vurdere å bruke laboratoriet på skolen eller arbeidsplassen, slik at du ikke trenger å kjøpe dem selv. Du kan også enkelt kjøpe disse materialene på nettet eller besøke en spesialitetsvarebutikk i ditt område.